Innodb, myisam dan aria adalah storage-engine pada mysql/mariadb. Innodb biasanya untuk database tipe 'transaction'. Secara umum semua aplikasi yang butuh mysql bisa pilih innodb, myisam atau aria. Aria sendiri adalah 'pengambangan' dari myisam dan hanya ada di mariadb (ingat Kloxo-MR 7.0 pakai mariadb dan bukan mysql). Mariadb sendiri adalah buatan si 'pencipta' Mysql setelah dianya keluar dari organisasi MySQL (setelah MySQL dibeli oleh Oracle).
Karena 'adanya' si Oracle ini kebanyakan distro Linux pindah dari MySQL ke MariaDB. Ingat, CentOS 7 pakai MariaDB dan bukan MySQL.