Dari sysinfo, terlihat nginx dan apache terinstall sedangkan keterangan anda hanya pakai nginx. Untuk ini, coba 'yum remove httpd* -y; sh /script/fixweb; sh /script/restart-web'.
Karena anda pakai Kloxo-MR 6.5 (feature lebih terbatas daripada 7.0), pada kasus anda, jika ada beberapa domain maka coba pindahkan ke client berbeda melalui feature 'change owner'.