Saya pikir, terlalu banyak partisi di server. Dalam banyak kasus malah buang-buang space. Misalnya /var sebesar 9.7G yang hanya terpakai 4% maka artinya 96% tidak terpakai dan sia-sia.
Jika partisi anda hanya '/' dan 'swap' maka semua dir seperti /home, /usr dan /var akan ambil (share) dari '/'.
Pada kasus anda, directory selain /home, /backup, /usr dan /var akan ambil dari / (/dev/sda1) yang besarnya hanya 9.7G.