Dari link yang anda sebutkan tidak ada keterangan untuk tambah epel.repo dan mod-pagespeed.repo.
Coba hapus 'epel.repo', 'epel-testing.repo' dan 'mod-pagespeed.repo' dan kemudian jalankan 'yum clean all; sh /script/upcp -y'.
Jika belum ada data yang penting, ulangi install OS dan Kloxo-MR. Ingat, hostname sudah benar dan tidak ada tambahan epel dan mod-pagespeed repo.