Umumnya, jika ada perintah yang sama maka yang terakhir yang akan dieksekusi.
Tapi, ini tidak jaminan. Misalnya di apache perintah 'listen 80' tidak bisa dioverride sehingga anda akan lihat di /etc/cond/httpd.conf berupa:
# MR -- must be disable here because can not overrite! -- importance for proxy-to-apache
# Listen 80
.
Hal ini karena apache menjalankan 'early listen'. Ini berbeda dengan web server yang lain yang umumnya 'late listen'.