Jika diasumsikan dns sudah benar, coba pakai 'old trick' untuk web dan dns server dan php-type. Langkahnya, ubah web dan dns ke pilihan lain (misalnya lighttpd dan djbdns) dan kemudian kembalikan ke semula (misalnya nginx-proxy dan nsd). Begitu juga untuk php-type, ubah ke 'php_mod_ruid2' dan kemudian kembalikan ke 'php-fpm_event'.
Setelah langkah ini, pastikan tidak ada warning/error ketika menjalankan 'sh /script/restart-all -y'.