Jika pakai myisam sebagai storage engine caranya cukup mudah:
1. Pastikan isi directory /var/lib/mysql/ tidak ada file ib_logfile0 dan yang sejenis
2. Jika memang memang pakai myisam (bukan innodb) maka jalankan perintah ini:
# service mysql harus distop dulu
service mysql stop
# rename directory mysql
mv -R /var/lib/mysql_original
# buat directory baru and ownership
mkdir -p /var/lib/mysql
# mount hd baru ke directory baru; pastikan nama 'sdb' sudah benar dengan perintah 'fdisk'
mount -t ext3 /dev/sdb /var/lib/mysql
# copy dari tempat lama dan sesuaikan ownership
cp -r /var/lib/mysql_original/* /var/lib/mysql/
chown -R mysql:mysql /var/lib/mysql/
# jalankan mysql
service mysqld restart
### jika berjalan lancar; data lama bisa dihapus
# rm -rf /var/lib/mysql_original